過年最讓家庭主婦傷腦筋的，除了年菜的製備外，就是數量龐大的年菜該如何妥善保存。
許多人都習慣把買來的食材一股腦兒全塞到冰箱裡，結果往往影響冷藏及冷凍的效果，進而減短食材保存的期限；建議冰箱的空間最好只放七、八分滿，以便冷氣循環，食材較能保鮮，也不致相互干擾味道。
各種不同的食材中，肉品最好以每餐的份量分別包裝，以免反覆解凍，易孳生細菌、營養流失；海鮮類保存時間較短，僅1-2天，若非馬上烹調，應放冷凍庫較安全；蔬菜類則宜先前處理，將枯葉、水分去除，用報紙包好再冷藏。
烹調好的菜餚若未吃完，應儘早放入冷藏，否則室溫若超過15℃，細菌就會快速生長，使食物腐敗。如果量太多，最好分裝成幾份，並在包裝上寫日期，再放入冷凍庫，食用時只要拿出所需份量即可，且加熱時要讓菜餚均勻受熱，中心溫度達65℃以上，才有殺菌效果。
此外，購買現成年菜應注意營養標示，了解食材內容、產地、營養成分、保存方式、保存時間，選擇有品牌的店家，品質較有保障。
當然，要解決年菜保存的問題，最有效方法是別買太多、煮太多。畢竟現在賣場過年期間都不休息，不必擔心買不到菜，要吃多少，就買多少、煮多少，不但可確保食材新鮮，也能避免不當保存或反覆加熱，減損了食物的營養價值。