由於有些人腸道消化液缺乏將異種蛋白(如海鮮或導致過敏物質所含的蛋白質)充分消化的酵素，不能將異種蛋白充分消化。
這些人腸道內缺乏分泌性免疫球蛋白A（SIgA）的抗體，腸道粘膜得不到保護，此時腸道內細菌在腸道粘膜上生長、繁殖，使腸道粘膜發炎、血管通透性增加，而未經充分消化的異種蛋白質、肽類物質便可作為抗原物質被吸收入血，人體便產生針對這些抗原的抗體，此種抗體吸附在某些細胞表面而使細胞致敏，當再次進食相同的食品時，這些被致敏的細胞便可釋放出如組織胺、白三烯等生物活性物質，使腸道平滑肌收縮痙攣、腸道毛細血管擴張、通透性增加、腸道腺體分泌增加，出現腹痛、腹瀉症狀，或是產生蕁麻疹的症狀。因此對海鮮過敏的人最好盡量避免食用導致過敏的海鮮。